Genoom in 3-D
Onderzoekers van de University of Massachusetts Medical School zijn erin geslaagd een 3-D beeld te creëren van het gehele genoom in de celkern. Hiermee is de specifieke manier waarop het 2 meter lange DNA is opgevouwen voor het eerst zichtbaar.
De onderzoekers bouwden het model met behulp van Hi-C, een nieuwe, zelfbedachte methode die laat zien welke stukken chromatinesegmenten ruimtelijk dicht bij elkaar liggen, door ze te detecteren en te sequencen. Het team deed dit vervolgens met zoveel mogelijk segmenten en maakte zo een soort matrix. Software berekende daarna aan de hand van al deze informatie een 3-D model.
Gevolgen
Volgens onderzoeksleider Job Dekker is het resultaat een stap in een veelbelovende richting, want de manier waarop een chromosoom zich vouwt heeft uiteindelijk gevolgen voor de activiteit van genen. “Er vindt communicatie plaats tussen stukken DNA wanneer deze niet zo ver van elkaar liggen. Het 3-D beeld laat goed zien door welk DNA een bepaald stuk wordt omringd en dus beïnvloed wordt. Hier kunnen we heel veel van leren,” aldus Job Dekker.
Bron: Science, 19 oktober 2009
