Zo werkt een microarray voor hoeveelheid DNA
DNA fragmenten
Uit de cellen van een tumor isoleert men fragmenten DNA. Deze fragmenten krijgen een rood fluorescerend molecuul als label. De rood gelabelde fragmenten worden in contact gebracht met een microarray waarop groen gelabelde DNA-fragmenten van gezonde cellen aanwezig zijn. Daarbij wordt er voor gezorgd dat het aantal gebruikte tumorcellen ongeveer overeenkomt met het aantal gebruikte gezonde cellen. Elk van de duizenden stipjes op de microarray bevat een ander genfragment.
- Illustratie: Sebastiaan Donders
Kleuren
Wanneer er ongeveer even veel rood als groen label aanwezig is, kleurt het stipje op de microarrayplaat geel. Vrijwel alle stipjes op de plaat kleuren geel. De reden is dat het merendeel van de DNA-fragmenten in tumorcellen in even grote hoeveelheden aanwezig is als in gezonde cellen. Sommige stipjes kleuren rood; dat kan wijzen op een duplicatie in het tumor DNA. Sommige stipjes kleuren groen. Dat betekent dat het betreffende DNA-fragment meer aanwezig is bij gezonde cellen dan in tumorcellen. Het wijst op een deletie (gat) bij de kankercellen.
